Viện Môi Trường và Tài Nguyên (IER) được thành lập theo quyết định số 4641/GD-ĐT do Bộ trưởng Bộ Giáo Dục và Đào Tạo ký ngày 24/10/1996. Đến năm 2001, Viện Môi Trường và Tài Nguyên trở thành đơn vị thành viên của Đại Học Quốc Gia Thành Phố Hồ Chí Minh theo quyết định số 15/2001/QĐ-TTg ngày 12/2/2001 của Thủ Tướng Chính Phủ về việc tổ chức lại Đại học Quốc Gia TpHCM.

Công tác quan trắc và đánh giá chất lượng môi trường do Chi cục Bảo vệ Môi trường Tp.HCM thực hiện là một trong những công tác quan trọng nhất để quản lý chất lượng môi trường và tìm ra giải pháp khắc phục kịp thời các sự cố góp phần bảo vệ nguồn tài nguyên nước và môi trường.

Mạng lưới trạm điều tra cơ bản khí tượng thủy văn nhằm đáp ứng yêu cầu số liệu điều tra cơ bản, phục vụ dự báo KTTV, phục vụ phát triển kinh tế xã hội đảm bảo an ninh quốc phòng. Mạng lưới trạm được phân bố trên khắp mọi miền của đất nước, bao gồm cả đồng bằng, miền núi, hải đảo và vùng chủ quyền lãnh hải.